李从年随后又询问了关于东海海盗何时可以剿灭的事情。现在大明的军队正在进行大变革，李从年打算以南洋舰队为基础开始打造大明的三大海军，保护大明的海上利益。
对于何时剿灭海盗刘香，郑芝龙不敢随便做出保证，他只是承诺尽力而为，既然已经接受了镇北侯收编，郑芝龙和李从年商议了整顿的办法，郑家可以把自己的核心人员抽出，战船全部交给朝廷分配，等国税收上来之后，朝廷给予郑家补偿。
而对于海军军法司和军事人员进驻的决定，郑芝龙也同意了。他知道这些都是朝廷必须要做得事情，换做是他他也不希望大明的海疆之上出现一个不不听话的巨无霸出现，而郑芝龙回去之后立马让人送来了自己的嫡长子，郑成功入皇家军事学院学习，这是郑芝龙向大明朝廷和李从年表明的决心。
虽然郑家有些对交出船队有些异议，可是在郑芝龙和朝廷巨大得压力之下，郑家没有办法只得妥协。不久之后，当郑芝龙接受到一艘艘打造好的巨大战船之后，郑芝龙才明白要是当初他不妥协，镇北侯也有办法自己组建三大大军，虽然耗费的时间要漫长一些，毕竟培育水手是需要很长的时间的，而这也更加坚定了郑芝龙跟随李从年脚步决心。
为了维护大明的沿海利益，李从年上书迁出沿海各省无田地的贫民，准备移民台湾，内阁大臣为这件事情进行了讨论。“皇上，这移民开发必须现在开始准备，否则将会耽误明年的春耕，臣建议各地统计人数，采取自愿迁移的办法，为移民台湾做准备。”内阁大臣林永泰道。
“嗯，好，就按照内阁拟的办法办！”崇祯望着内阁拟出得办法，望着上面详细的计划。
内阁首辅大臣钱谦益看见崇祯还没有看到详细的那个部分，只见他上前对崇祯直接解释道：“臣会首先在沿海各地鼓动宣传，征集愿迁移各户的壮丁先行，在第二年春耕前，先开垦部分耕地，且建筑一定数量的民房，以便于第二年家属的迁居，然后根据每家人丁数划定的土地，而且由朝廷提供农具和种子。”
“恩！这个计划不错！朕会吩咐工部加紧制作农具的。但是在这移民过程中，一定要做好杜绝下面官员的贪污，还有不能急功近利引起百姓的怨言！”虽然现在大明各地监察司和都察院等检查机构已经日益完善，可是崇祯还是对地方官员十分的不放心，要知道这些官员真的贪污起来是，对百姓伤害是最大的。
“臣已经想出了办法，就是由中枢抽调各部官员组织检查组去各省督查，以防止贪污事件的出现。”钱谦益站起起身，郑重答道。
“恩！爱卿这个主意不错！诸位爱卿，这贪腐之事对于百姓的危害实在太过重大，那些官员贪污一分，底下的百姓就会多受一番苦，对朝廷就回离心离德，到那时候百姓们都起来造反，这大明可就危险了。这才是朕最为担心之处。”崇祯语重心长地对着满堂的内阁大臣说道。
“皇上放心，臣以为在诸多律法和机构的督查下，贪腐之事必将越来也少！皇上不妨心的话，可以采取统一购买，统一发放的原则，这样就减少那些官员贪污的基础！”面对崇祯的疑虑，李从年想了想站起来说道。
“哈哈哈，镇北侯这个办法不错！内阁草拟一个办法出来，大家讨论下。”崇祯脸上大笑了下，对钱谦益说道。
“现在说一说关于移民的管理。”李从年拿出一张单看了看，想了想说道。现在内阁开会和后世官员开会差不多，都是提出问题大家讨论，然后想出一个最完善的解决办法来。
明朝的户籍制度是采取黄册登记的政策，也就是没到一个家庭有人丁成年，地方官员就会统计人数上报，可是这种制度到了后期已经成为了一种形式上的东西，根本起不到任何作用。
李从年曾经翻查过户部上报过最近几十年的人口数量，却没想到没想到竟然在和平年代，几十年间都是六千万的人口，根本没有半点增长，更令李从年觉得不可思议的是，有几年连续全国人口没有变化，竟然会出现死一人即生一人，生一人则有一人死去的统计数据出现。
而李从年在详细翻阅之下，才发现原来在明朝开国之初，整个大明的人口就已经达到五千多万的人口。可是一百多年过去了，整个大明朝的人口却只是增加几百万人，这还不算这个时代因为医疗水平低下带来的婴儿死亡几率！
望着户部这人口丁数得计算，李从年觉得这存数扯淡，虽然这里面也有交通困难，许多隐蔽人口无法统计的因数。可是却不能成为户部不作为的借口，根据户口黄册的这个数据，让李从年坚定了必须改革户籍制度，这个黄册对制定国家大得政策来说，根本就没有任何的参考价值，反而会给人一种错误的参考。
而台湾移民的管理不能再像大明人口的管理，李从年根据地方义勇队的管理办法想出了一个办法来。要是将台湾移民组织起来，临时成立移民团，每百人自行推举一人管理，由被推举之人组成监督委员会可以监督一切与他们有关之策，凡未按朝廷旨意办事者，皆可按军法处置。如是吏员克扣贪污，则可以按军律斩首示众，如是官员贪污的话，那首先就地免职，再进行大明律法处置。
李从年提出这个组织民团的主意顿时让在场内阁大臣顿时说出话来，百姓原本是布衣，可是现在在李从年的办法之下似乎有了和官员平起平坐的权利，还有更自行推举官员的权利，这个方法似乎不太妥当，难道李从年不怕百姓们结社造反吗？
“侯爷，这个办法似乎有欠妥当吧！”兵部尚书洪承畴皱着眉头道，就是旁边的崇祯也是满脸的不解，李从年这个办法虽然直接简答，可是弊端却还是出现。
“皇上，诸位阁老！”李从年站起身来解释道；“百姓们为什么造反，还不是因为活不去，现在朝廷给他们土地，给他们吃饱饭的机会，百姓们难道吃饱了撑的？宁愿放弃到手的土地也不要，举旗造反?”
李从年这话让在的内阁大臣沉吟了下，吩咐沉默不语起来。崇祯看到这里总结道：“既然如此，举手表决！”崇祯率先举手表示同意，很快内阁以五比三的投票，通过了这项决议。
“既然这件事情定下了，就照镇北侯的办法办”崇祯想了想道，有了这些办法，虽不能完全杜绝贪污腐败，至少也增加了腐败的难度，而且也能调动百姓的积极性，为了不让百姓形成家族势力，李从年提议把各地百姓打散安置，这个也被内阁接受了。
礼部是明朝管理礼仪祭祀封爵学校贡举及外蕃朝贡的机构。钦天监，则是礼部下属，掌管观察天象推算节气历法的机构。这时的钦天监，并不是简单的看看天象，研究天文的地方，各种自然天象的预测解释，很能左右朝廷的政策实施。
历法，也不是简单的年月日，而是象征着天下正朔执政基础的，大明朝廷要想变革，就必须如有新的历法辅助，获得民间认同的。虽然李从年可以凭着手里的权利推行改革，可是来到这个时代的李从年知道，如果做什么事情都要凭着强权的话，这对国家是十分不利的。
所以他就联系了汤若望邓玉函等耶稣传教士，通过他们启奏崇祯进行修改历法。而且正在施行的《大统历》，自明初以来，即已显出多处错误，根据其历法天象推断多次失误，近百年来屡有上疏要求修改历法。
汤若望邓玉函等人都是非常精通西方的天文算术几何的传教士，又有刚刚当上大明内阁首辅大臣钱谦益的大力支持，早就多次上奏了。就是这个时候李从年才知道钱谦益也是耶稣会的信徒。
因此在这一日文华殿问对上，钱谦益不得不借着内阁首辅大臣的官威，进行上任三把火。“哦，爱卿是说，现在历法错误太多，函需重修？”崇祯有些诧异地望着钱谦益道，虽然古人常说天子授命于天，可是这些东西皇帝心里却是不信的，要是天真的存在，那还要皇帝干什么。
“皇上明鉴！我朝《大统历》年代久远，计算天象时候误差渐大，早已不适用当今之事。前朝时候多有大臣上疏修订新历，只是所修新历皆不尽如人意这才作罢。而现在皇上锐意革新，求新图变正需颁发新历，以正天下视听，所以臣请重修历法。”钱谦益郑重其事说道。
既然你们说我没有任何政绩，当不得这个首辅，那我就做出政绩来，让所有人都无话可说。这一日钱谦益似乎要打响名声了，在内阁之会一开始，他就提出修订历法的事情来。旁边的李从年望着钱谦益赤膊上阵，老当益壮的摸样，心里一阵好笑，这钱谦益真是人老心不老啊！看来当初没有选举错人。
“爱卿提议重新修订历法，朕倒觉得这件事可以去做。就是不知道有什么人能做修订历法”崇祯想了想面上有些疑惑道，他也知道历法是该修修了，可是到底何人来修，崇祯也是满头雾水。
“臣耶稣会的教友汤若望邓玉函可担此重任”钱谦益想了想，嘴里列举几个人道。
“钦天监对大统历有何看法？”既然要修历法，崇祯也把大明钦天监叫了过来，毕竟中西交流才是王道。崇祯和李从年没有想到当钦天监的人来了之后，却是举行了一场中西历法的大讨论的，而讨论的结果却是坚定了修订历法的结果，对此两个无神论着的崇祯和李从年却是哑然失笑，内阁竟然都变成了讨论这种话题的地方了。
可是他们两人不信，不能代表天下人都不信啊！所以在结果出来之后，崇祯让户部拨出银子，让汤若望等人组织修订新编历法。
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